研究 GitHubの基礎から論文にコードを公開するまでの方法
GitとGitHubの使い方に関する発表を行った時の資料を公開します。
実際にGitHubを使ってどのように操作するのかから、プログラムコードを論文に載せるためにはどのような操作するのかを説明しています。
論文データや解析プロ...
neuroscience
研究 
SLEAP SLEAPのインストール方法[2024年2月更新]
SLEAPという機械学習を用いた動物の身体部位のトラッキングツールのインストール方法について書いていきたいと思います。
DeepLabCutがトラッキングツールとして最もメジャーであり僕自身も過去にインストール方法について書いたり、...
Anaconda Python Video Annotatorインストール方法
Python Video Annotatorとは
Python Video Annotatorとは、撮影した動画を解析、動画内のイベントを時系列的にノートすることができるアプリケーションです。
神経科学や行動学の研究者が、動...
Bonsai Bonsaiによる四則演算の方法
神経科学及び、その他の実験デザインとしてよく使われるBonsai。Bonsaiはプログラムをしなくとも、高度なプログラムを作ることができ、そして同期性を持ってプログラムを実行することができます。
しかし、シンプルが故に、四則演算など...
DeepLabCut 深層学習を用いた行動解析ツール DeepLabCut
(上の画像が論文へのリンクとなっています。)
生物学における行動解析は非常に重要な実験であり、特に脳の理解には行動を正確に定量が必要不可欠です。
従来ではマーカー(センサーなど)を実験対象(人や実験動物など)に用いるこ...
Bonsai Visual programing languageとしてのBonsai
Bonsaiは2015年に論文で発表されたVisual programming languageです。Bonsaiを使うことでセンサーからの情報を取得し、処理を同時に行うことを可能としたものです。
Bonsaiの特徴として、...